利用KASP标记评价水稻品种多态性

doi:10.19640/j.cnki.jtau.2018.04.004

天津农学院学报 ›› 2018, Vol. 25 ›› Issue (4): 13-16.doi: 10.19640/j.cnki.jtau.2018.04.004

利用KASP标记评价水稻品种多态性

程萌杰¹, 闫双勇², 施利利^1,3, 孙宁¹, 张欣^1,3, 丁得亮^1,3, 边嘉宾^{1,3,通信作者}, 王松文^{1,3,通信作者}

1. 天津农学院农学与资源环境学院,天津 300384;
2. 天津市水稻研究所,天津 300384;
3. 天津中日水稻品质食味研究中心,天津 300384

收稿日期:2018-09-18 出版日期:2018-12-20 发布日期:2019-11-12
通讯作者: 边嘉宾（1977-）,男,副研究员,博士,主要从事水稻育种研究。E-mail：4295997@qq.com。王松文（1958-）,男,教授,博士,主要从事水稻育种研究。E-mail：dw186001@aliyun.com。
作者简介:程萌杰（1993-）,女,硕士在读,主要从事水稻育种研究。E-mail：1191107941@qq.com。闫双勇（1974-）,男,副研究员,硕士,主要从事水稻育种研究。E-mail：niceone02@163.com。程萌杰和闫双勇对本文具有同等贡献,为并列第一作者。
基金资助:
天津市科技计划项目（16ZXZYNC00110）

Evaluation of rice variety polymorphisms using KASP markers

CHENG Meng-jie¹, YAN Shuang-yong², SHI Li-li^1,3, SUN Ning¹, ZHANG Xin^1,3, DING De-liang^1,3, BIAN Jia-bin^{1,3,Corresponding Author}, WANG Song-wen^{1,3,Corresponding Author}

1. College of Agronomy and Resource Environment, Tianjin Agricultural University, Tianjin 300384, China;
2. Tianjin Rice Research Institute, Tianjin 300384, China;
3. China-Japan Joint Center on Palatability and Quality of Rice in Tianjin, Tianjin 300384, China

Received:2018-09-18 Online:2018-12-20 Published:2019-11-12

摘要/Abstract

摘要： 采用600个KASP标记对51个品种进行多态性评价。结果表明：373个标记可以准确判定种质的单倍型,制定DNA指纹图谱,鉴定染色体片段代换系,其中有两个染色体片段代换系分别携带NOG1基因和GS5基因。由51个品种构成一个自然群体,其多样性为568.50,粳型杂交稻保持系341B与HC-66（籼稻）的多态性为0.82,‘341B’与‘IPM’（籼稻）的多态性为0.80。373个标记可用于设计育种与模块育种。

关键词: 水稻, KASP标记, 多态性, 染色体片段代换系

Abstract: Polymorphisms were evaluated in 51 varieties using 600 KASP markers. The results showed that 373 markers could accurately determine the haplotypes of the germplasm, develop DNA fingerprints, and identify chromosome fragment substitution lines, among which two chromosomal fragment substitution lines carry the NOG1 gene and the GS5 gene, respectively. A natural population consists of 51 varieties, with the diversity 568.50. The polymorphism of 341B and HC-66（indica）is 0.82, and the polymorphism of 341B and IPM（indica）is 0.80. 373 markers can be used for breeding by design and module breeding.

Key words: rice, KASP marker, polymorphism, chromosome fragment substitution system

中图分类号:

S336

程萌杰, 闫双勇, 施利利, 孙宁, 张欣, 丁得亮, 边嘉宾, 王松文. 利用KASP标记评价水稻品种多态性[J]. 天津农学院学报, 2018, 25(4): 13-16.

CHENG Meng-jie, YAN Shuang-yong, SHI Li-li, SUN Ning, ZHANG Xin, DING De-liang, BIAN Jia-bin, WANG Song-wen. Evaluation of rice variety polymorphisms using KASP markers[J]. Journal of Tianjin Agricultural University, 2018, 25(4): 13-16.

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Evaluation of rice variety polymorphisms using KASP markers

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