肺炎克雷伯氏菌16S rRNA基因遗传演化关系分析

doi:10.19640/j.cnki.jtau.2025.06.002

天津农学院学报 ›› 2025, Vol. 32 ›› Issue (6): 8-12.doi: 10.19640/j.cnki.jtau.2025.06.002

肺炎克雷伯氏菌16S rRNA基因遗传演化关系分析

王永贞, 吴定洲, 冉恒东, 刘燕霏^通信作者, 杨建德^通信作者

天津农学院动物科学与动物医学学院天津市农业动物繁育与健康养殖重点实验室,天津 300392

收稿日期:2022-09-29 发布日期:2025-12-26
通讯作者: 刘燕霏（1970—）,女,副教授,硕士,研究方向为预防兽医学。E-mail：674383573@qq.com;杨建德（1969—）,男,教授,博士,研究方向为预防兽医学。E-mail：jiandeyang@126.com。
作者简介:王永贞（2001—）, 男, 本科在读, 研究方向：生物信息学。E-mail：2102388116@qq.com。
基金资助:
天津市自然科学基金（07BJC16000）

Genetic evolution analysis of 16S rRNA gene in Klebsiella pneumoniae

Wang Yongzhen, Wu Dingzhou, Ran Hengdong, Liu Yanfei^{Corresponding Author}, Yang Jiande^{Corresponding Author}

Tianjin Key Laboratory of Agricultural Animal Breeding and Healthy Husbandry, College of Animal Science and Veterinary Medicine, Tianjin Agricultural University, Tianjin 300392, China

Received:2022-09-29 Published:2025-12-26

摘要/Abstract

摘要： 为探索肺炎克雷伯氏菌（Klebsiella pneumoniae, Kp）的遗传演化关系, 试验采用生物信息学方法, 用本实验室分离出的两株Kp的Genbank号在NCBI官网进行Blast查询, 下载来自不同地区的26株Kp的16S rRNA基因序列, 对齐剪裁后进行同源性比较并构建系统进化树。结果表明：Kp形成了多国间广泛传播, 同一国家的Kp无明显的区域聚集现象。人口大国的Kp传播更频繁, 如中国和美国的菌株与多国菌株亲缘关系接近, 且距离在一定程度上影响亲缘关系远近。人口迁移大国巴基斯坦的菌株与丹麦、德国、荷兰菌株关系密切, 澳大利亚的菌株与美国菌株关系密切。所选参考菌株起源于共同的祖先, 本研究结果为防控Kp传播提供了参考依据。

关键词: 肺炎克雷伯氏菌, 遗传演化, 进化树, 同源性

Abstract: In order to explore the genetic evolution relationship of Klebsiella pneumoniae（Kp）, bioinformatics method was used in the experiment. The Genbank numbers of two Kp strains isolated in our laboratory were used for Blast query on the official website of NCBI. The 16S rRNA gene sequences of 26 Kp strains from different regions were downloaded, aligned and clipped, and the homology was compared and the phylogenetic tree was constructed. The results showed that Kp spreaded widely among countries, and Kp in the same country had no obvious regional clustering phenomenon. Kp transmission was more frequent in populous countries. For example, China and the United States were closely related to strains from many countries, and distance affected the distance of kinship to a certain extent. Pakistan, a country of large migration population, was closely related to strains from Denmark, Germany and the Netherlands, and Australia was closely related to strains from the United States. The selected reference strains originated from a common ancestor, and the results of this study provide a reference for the prevention and control of the transmission of Kp.

Key words: Klebsiella pneumoniae, genetic evolution, evolutionary tree, homology analysis

中图分类号:

S852.61

王永贞, 吴定洲, 冉恒东, 刘燕霏, 杨建德. 肺炎克雷伯氏菌16S rRNA基因遗传演化关系分析[J]. 天津农学院学报, 2025, 32(6): 8-12.

Wang Yongzhen, Wu Dingzhou, Ran Hengdong, Liu Yanfei, Yang Jiande. Genetic evolution analysis of 16S rRNA gene in Klebsiella pneumoniae[J]. Journal of Tianjin Agricultural University, 2025, 32(6): 8-12.

导出引用管理器 EndNote|Reference Manager|ProCite|BibTeX|RefWorks

链接本文: http://xuebao.tjau.edu.cn/CN/10.19640/j.cnki.jtau.2025.06.002

http://xuebao.tjau.edu.cn/CN/Y2025/V32/I6/8

参考文献

[1] 孙雪岩, 刘玉梅, 张天琪, 等.兔源性肺炎克雷伯氏菌的研究现状及进展[J].中国养兔杂志, 2021(3):24-29.
[2] 刘保光, 贺志沛, 吴华, 等.兽医临床肺炎克雷伯菌的流行现状及防治措施研究[J].农业灾害研究, 2013, 3(8):3.
[3] 彭涛, 温博海, 蹇锐, 等.分支杆菌临床分离株的16S rRNA基因序列分析[J].中国人兽共患病杂志, 2004(9):772-776.
[4] 欧冠标, 周雨晴, 彭昊, 等.猪源肺炎克雷伯氏菌耐药性及毒力基因分析[J].中国动物检疫, 2021, 38(6):10.
[5] 高静, 焦雅, 张文广, 等.高通量测序序列比对研究综述[J].生命科学研究, 2014, 18(5):458-464.
[6] 任君, 乔启, 张晴, 等.犬源肺炎克雷伯氏菌的分离与鉴定[J].黑龙江畜牧兽医, 2020(6):63-66, 156.
[7] 沈路明.利用进化树研究基因序列的进化[D].南宁:广西大学, 2014.
[8] 迟文静, 刘宜昕, 王粟, 等.进化树在细菌亲缘关系分析中的应用研究[J].检验医学, 2020, 35(12):5.
[9] 韩坤, 白雪, 闫喜军, 等.貂源肺炎克雷伯氏菌的分离及毒力和耐药性的分析[J].中国兽医科学, 2018, 48(8):1019-1023.
[10] 张昕, 张自强, 刘玉梅.耐药性兔源肺炎克雷伯菌的研究进展[J].中国养兔杂志, 2022(1):26-29, 33.
[11] 陈金玉, 刘单阳, 蓝蔚青, 等.3种天然产物联合抗生素对肺炎克雷伯氏菌的协同抗菌作用[J].上海海洋大学学报, 2022, 31(2):586-593.
[12] 赵位.2株林麝源肺炎克雷伯氏菌的全基因组序列分析和新基因Kp05372的原核表达[D].雅安:四川农业大学, 2018.
[13] 梁昱, 刘燕霏, 杨建德.猪胸膜肺炎放线杆菌的遗传演化关系分析[J].黑龙江畜牧兽医, 2018(9):103-105, 110.
[14] HAMIDOU S I, LINE B, HARVILL E T.Environmental origin of the genus Bordetella[J].Front Microbiol, 2017, 8:28.
[15] HAMBAL M, ADMI M, SAFIKA S, et al.Identification of Staphylococcus species isolated from preputium of Aceh cattle based on 16S rRNA gene sequences analysis[J].Veterinary World, 2019, 12(10):1540-1545.

肺炎克雷伯氏菌16S rRNA基因遗传演化关系分析

Genetic evolution analysis of 16S rRNA gene in Klebsiella pneumoniae

PDF

可视化

摘要/Abstract

引用本文

使用本文

参考文献

相关文章 6

编辑推荐

Metrics

本文评价

[1]	李文军, 王欢欢, 邵笑, 刘野, 李文忠, 孙英峰. 2019—2022年天津地区猪繁殖与呼吸综合征病毒ORF5基因遗传演化分析[J]. 天津农学院学报, 2024, 31(1): 71-77.
[2]	刘俊华, 周忆莲, 崔垚鑫, 刘燕霏, 杨建德. 埃希氏菌的遗传演化关系分析[J]. 天津农学院学报, 2022, 29(4): 43-48.
[3]	周忆莲, 崔垚鑫, 刘俊华, 刘燕霏, 杨建德. 粪肠球菌遗传演化关系分析[J]. 天津农学院学报, 2021, 28(2): 47-50.
[4]	晚安琪, 蔺晓云, 黄亮, 班立桐, 孙宁, 王玉, 李奕葶. 一株侧耳属野生菌的分离鉴定及初步驯化栽培[J]. 天津农学院学报, 2020, 27(2): 28-30.
[5]	崔垚鑫, 刘俊华, 周忆莲, 刘燕霏, 杨建德. 铜绿假单胞菌遗传演化分析[J]. 天津农学院学报, 2020, 27(2): 52-55.
[6]	陆璐, 张希墨, 刘燕霏, 杨建德. 犬源粪肠球菌的分离与鉴定[J]. 天津农学院学报, 2018, 25(2): 47-50.