铜绿假单胞菌遗传演化分析

doi:10.19640/j.cnki.jtau.2020.02.012

天津农学院学报 ›› 2020, Vol. 27 ›› Issue (2): 52-55.doi: 10.19640/j.cnki.jtau.2020.02.012

铜绿假单胞菌遗传演化分析

崔垚鑫, 刘俊华, 周忆莲, 刘燕霏, 杨建德^通信作者

天津农学院动物科学与动物医学学院,天津 300384

收稿日期:2019-05-13 出版日期:2020-06-30 发布日期:2020-07-03
通讯作者: 杨建德（1969-）男,教授,博士,主要从事预防兽医学方面的教学与研究。E-mail：jiandeyang@126.com。
作者简介:崔垚鑫（1997-）男,本科在读,研究方向：预防兽医学。E-mail：1977008536@qq.com。
基金资助:
国家级大学生创新创业项目（201810061047）; 天津市自然科学基金项目（07JCYBJC16000）

Genetic Evolution Analysis of Pseudomonas aeruginosa

CUI Yao-xin, LIU Jun-hua, ZHOU Yi-lian, LIU Yan-fei, YANG Jian-de^{Corresponding Author}

College of Animal Science and Veterinary Medicine, Tianjin Agricultural University, Tianjin 300384, China

Received:2019-05-13 Online:2020-06-30 Published:2020-07-03

摘要/Abstract

摘要： 为研究铜绿假单胞菌（Pseudomonas aeruginosa,Pa）的遗传演化规律,对2018年本实验室分离出两株铜绿假单胞菌,经基因测序得到16s rRNA基因序列,利用NCBI中的BLAST对比搜索与分离菌株具有相近基因序列的假单胞菌株,采用lasergene 中Megalign软件构建基因进化树并比较分析。结果表明：Pa菌株在基因进化树上聚为一支,说明Pa进化较稳定,分离出的两株Pa与来自日本的Pa（登录号为NR_113599）关系最为亲近,他们聚在一个次级分支上;分离菌株与来自美国的两株Pa（登录号为NR_117678与NR_114471）关系较亲近,而与来自德国的Pa（登录号为NR_026078）关系则较远。

关键词: 铜绿假单胞菌, 遗传演化, 基因树, 亲缘关系

中图分类号:

S852.61

崔垚鑫, 刘俊华, 周忆莲, 刘燕霏, 杨建德. 铜绿假单胞菌遗传演化分析[J]. 天津农学院学报, 2020, 27(2): 52-55.

CUI Yao-xin, LIU Jun-hua, ZHOU Yi-lian, LIU Yan-fei, YANG Jian-de. Genetic Evolution Analysis of Pseudomonas aeruginosa[J]. Journal of Tianjin Agricultural University, 2020, 27(2): 52-55.

导出引用管理器 EndNote|Reference Manager|ProCite|BibTeX|RefWorks

链接本文: http://xuebao.tjau.edu.cn/CN/10.19640/j.cnki.jtau.2020.02.012

http://xuebao.tjau.edu.cn/CN/Y2020/V27/I2/52

参考文献

[1] 蒋增海,邓同炜,徐耀辉,等. 猪源绿脓杆菌的分离鉴定及16S rRNA基因同源性分析[J]. 河南农业科学,2017,46(4):118-120.
[2] 闫新武,雷连成,张明亮,等. 貂源绿脓杆菌的分离鉴定及生物学特性[J]. 中国兽医学报,2014,34(10):1610-1614.
[3] 彭大新,张如宽,徐圻,等. 山羊绿脓杆菌感染的诊断[J]. 中国兽医科技,1997,27(2):37-38.
[4] 唐珂心,牛钟相,何元龙. 山羊慢性化脓性肺炎病原菌的分离鉴定[J]. 中国兽医杂志,2001,37(6):20-21.
[5] 靳双星,陈理盾,段继永. 雏鸡绿脓杆菌的分离鉴定及药敏试验[J]. 中国畜牧兽医,2011,38(7):230-232.
[6] 冯世文,李军,廖黎黎,等. 竹鼠绿脓杆菌的分离鉴定及耐药性分析[J]. 中国畜牧兽医,2013,40(12):182.
[7] Dewhirst F E,Paster B J,Olsen L,et al.Phylogeny of 54 representative strains of species in the family pasteurellaceae as determined by comparison of 16S rRNA sequences[J]. J Bacteriol,1992,174(6):2002-2013.
[8] 刘驰,李家宝,芮俊鹏,等. 16S rRNA基因在微生物生态学中的应用[J]. 生态学报,2015(9):2769.
[9] Tucker T,Marra M,Friedman J M.Massively parallel sequencing:he next big thing in genetic medicine[J]. Am J Hum Genet,2009,85(2):142-154.
[10] Anderson M W,Schrijver I.Next generation DNA sequencing and the future of genomic medicine[J]. Genes (Basel),2010,1(1):38-69.
[11] 竹堃园,刘燕霏,杨建德,等. 犬子宫蓄脓中绿脓杆菌分离鉴定及耐药性分析[J]. 天津农学院学报,2018,25(3):47-51.
[12] 王文贵,胡景韶,张道永. 动物感染绿脓杆菌的调查[J]. 中国兽医科技,1991(7):17-18.
[13] Hamidou Soumana I,Linz B,Harvill E T.Environmental origin of the genus bordetella[J]. Front Microbiol,2017,8:28.
[14] 陆春萌,李明义,刘新文,等. 猪胸膜肺炎放线杆菌ZY株TfbA基因的克隆及序列分析[J]. 畜牧与兽医,2007,39(2):11-13.

铜绿假单胞菌遗传演化分析

Genetic Evolution Analysis of Pseudomonas aeruginosa

PDF

可视化

摘要/Abstract

引用本文

使用本文

参考文献

相关文章 5

编辑推荐

Metrics

本文评价

[1]	李文军, 王欢欢, 邵笑, 刘野, 李文忠, 孙英峰. 2019—2022年天津地区猪繁殖与呼吸综合征病毒ORF5基因遗传演化分析[J]. 天津农学院学报, 2024, 31(1): 71-77.
[2]	刘俊华, 周忆莲, 崔垚鑫, 刘燕霏, 杨建德. 埃希氏菌的遗传演化关系分析[J]. 天津农学院学报, 2022, 29(4): 43-48.
[3]	周忆莲, 崔垚鑫, 刘俊华, 刘燕霏, 杨建德. 粪肠球菌遗传演化关系分析[J]. 天津农学院学报, 2021, 28(2): 47-50.
[4]	黄晗达, 杨静慧, 龚无缺, 刘艳军, 王茂思, 王葳. 7个樱桃品种亲缘关系的RAPD分析[J]. 天津农学院学报, 2018, 25(1): 5-8.
[5]	李雕, 杨静慧, 杨仁杰, 张伟玉, 吴楠, 张超. 5个树莓品种红外光谱差异性及其亲缘关系分析[J]. 天津农学院学报, 2017, 24(3): 24-27.